Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20918J3QN17 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20918J3QN17 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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