Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3415J3QMS8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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