Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm20834J3QM72 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm20834J3QM72 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm20834J3QM72 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm20834J3QM72 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm20834J3QM72 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20834J3QM72 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm20834J3QM72 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm20834J3QM72 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gm20834J3QM72 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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