Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms