Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm21818J3KMS6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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