Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20828J3KMI7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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