Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm29394H3BIW7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms