Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Taf4bG5E8Z2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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