Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms