Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r58G3X9U3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms