Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pnmal2G3X9N3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnmal2G3X9N3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms