Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6F8VPZ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ercc6F8VPZ5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms