Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm28048F7BCN0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm28048F7BCN0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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