Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17093F6XGJ4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms