Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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