Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17555F6U8B9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17555F6U8B9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17555F6U8B9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17555F6U8B9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17555F6U8B9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17555F6U8B9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17555F6U8B9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17555F6U8B9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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