Protein–RNA interactions for Protein: F6TQW2

Ighg2c, Immunoglobulin heavy constant gamma 2C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg2cF6TQW2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighg2cF6TQW2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighg2cF6TQW2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms