Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf165E9QAU8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf165E9QAU8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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