Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc141E9Q8Q6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms