Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdhr2E9Q7P9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms