Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85cE9Q6B2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms