Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms