Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms