Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17175E9Q528 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms