Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms