Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430401F13RikE9Q328 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms