Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms