Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3250E9Q1M3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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