Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt78E9Q0F0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms