Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdr1E9Q0B4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms