Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm20425E9Q035 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20425E9Q035 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms