Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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