Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms