Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms