Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9008E9PVG0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9008E9PVG0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9008E9PVG0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9008E9PVG0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9008E9PVG0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9008E9PVG0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9008E9PVG0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9008E9PVG0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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