Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms