Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms