Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms