Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms