Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc6D3YZP9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms