Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SafbD3YXK2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SafbD3YXK2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms