Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms