Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lce6aD3YV94 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lce6aD3YV94 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms