Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms