Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smok3bC0HKC9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smok3bC0HKC9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms