Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms