Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nxpe3B9EKK6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nxpe3B9EKK6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms