Protein–RNA interactions for Protein: B6A8R8

Tarm1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarm1B6A8R8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tarm1B6A8R8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tarm1B6A8R8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms