Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Phf11bB4XVQ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf11bB4XVQ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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