Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd34aB2RW11 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd34aB2RW11 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms